Staphylokokkeninfecties zijn een veelvoorkomend en belangrijk klinisch probleem in de medische praktijk. De meeste stammen van Staphylococcus aureus zijn nu resistent tegen penicilline, en meticillineresistente stammen van S. aureus (MRSA) komen vaak voor in ziekenhuizen en zijn in opkomst in de gemeenschap. Penicilline-resistente penicillines (flucloxacilline, dicloxacilline) blijven de antibiotica van keuze voor de behandeling van ernstige meticilline-gevoelige S. aureus (MSSA)-infecties, maar cefalosporinen van de eerste generatie (cefazoline, cefalothine en cefalexine), clindamycine, lincomycine en erytromycine spelen een belangrijke therapeutische rol bij minder ernstige MSSA-infecties zoals huid- en weke deleninfecties of bij patiënten met overgevoeligheid voor penicilline, hoewel cefalosporines gecontra-indiceerd zijn bij patiënten met een onmiddellijke overgevoeligheid voor penicilline (urticaria, angio-oedeem, bronchospasmen of anafylaxie). Alle ernstige MRSA-infecties moeten worden behandeld met parenterale vancomycine of, als de patiënt allergisch is voor vancomycine, met teicoplanine. Nosocomiale stammen van MRSA zijn gewoonlijk multiresistent (mrMRSA), en mrMRSA-stammen moeten altijd worden behandeld met een combinatie van twee orale antimicrobiële stoffen, meestal rifampicine en fusidinezuur, omdat resistentie zich snel ontwikkelt als deze als afzonderlijke stoffen worden gebruikt. De meeste in de gemeenschap verworven stammen van MRSA in Australië en Nieuw-Zeeland zijn niet multiresistent (nmMRSA), en lincosamiden (clindamycine, lincomycine) of cotrimoxazol zijn de antibiotica van keuze voor minder ernstige nmMRSA-infecties zoals huid- en weke delen-infecties. Nieuwe antibiotica zoals linezolid en quinupristine/dalfopristine hebben een goede antistafylokokkenactiviteit, maar zijn zeer duur en moeten worden gereserveerd voor patiënten die falen op de conventionele therapie of deze niet verdragen of die zeer resistente stammen hebben zoals hVISA (heterogene vancomycine-intermediate S aureus).