Het belangrijkste verschil tussen B2B en B2C is dat de eerste verwijst naar de handelstransactie tussen fabrikant en detailhandelaar, en de tweede naar de detailhandelaar die goederen levert aan de consument.
In B2B zijn er aan beide kanten zakenmensen, terwijl er in B2C normaal gesproken één zakenmens en één consument is. In het eerste geval wordt de beslissing ingegeven door de behoefte (omdat het andere bedrijf het nodig heeft), en in het tweede geval zijn het eerder verwachtingen dan behoeften.Bij B2B zijn er veel verkopers en verschillende winkels, terwijl er bij B2C meestal maar één leverancier is. B2B concentreert zich op ruwe gegevens voor een ander bedrijf, terwijl B2C zich concentreert op het produceren van iets voor de consument. Een B2B-transactie brengt direct contractbeheer met zich mee, waarbij onderhandeld moet worden over de voorwaarden waarin de prijzen en diverse andere factoren zoals volumeprijzen, vervoerder en logistieke voorkeuren, enz. worden vastgelegd. B2C-transacties zijn duidelijker, zij hebben spot sourcing contract management dat een vast retailtarief biedt voor elk verkocht artikel. Tijd is ook een verschil, aangezien B2B een trager proces heeft dan B2C, dat in kortere perioden wordt afgesloten (dat kunnen minuten of dagen zijn). Business-to-business vereist over het algemeen een investering vooraf, terwijl een bedrijf bij business-to-customers geen geld hoeft uit te geven aan infrastructuur. Het laatste verschil dat hier wordt genoemd is dat men bij B2B te maken heeft met back-office connectiviteit en het factureren van een aantal verschillende partners en leveranciers, terwijl B2C resulteert in meer naadloze transacties omdat opties, zoals cyber-cash, het bedrijf in staat stelt een grotere verscheidenheid aan betalingsmogelijkheden te accepteren. Aangezien het bij B2B gewoonlijk om grotere bedragen gaat die over langere perioden worden gespreid, zijn de kosten meestal hoger dan bij B2C, waar het meestal om snelle, dagelijkse transacties gaat.Bij B2B hangt de reputatie af van de persoonlijke relatie tussen de bedrijven. Bij B2C daarentegen wordt de reputatie van het bedrijf vaak gevoed door publiciteit en de media.
In veel gevallen is het totale volume van B2B-transacties (business-to-business) veel groter dan het volume van B2C-transacties. De belangrijkste reden hiervoor is dat er in een typische toeleveringsketen veel B2B-transacties zijn met betrekking tot subcomponenten of grondstoffen, en slechts één B2C-transactie, namelijk de verkoop van het eindproduct aan de eindklant. Een autofabrikant verricht bijvoorbeeld verschillende B2B-transacties, zoals de aankoop van banden, glas voor ruiten en rubberslangen voor zijn voertuigen. De uiteindelijke transactie, een afgewerkt voertuig dat aan de consument wordt verkocht, is een enkele (B2C) transactie.