Rancho Boca de la Playa, toegekend aan Don Emigdio Vejar, was de eerste landtitel die werd uitgegeven in het gebied dat nu bekend staat als Capistrano Beach. Het land werd in 1860 verkocht aan Juan Abila, en vervolgens in 1886 gekocht door Marcus A Forster. Forster verkocht een strook van het land aan de San Bernardino and San Diego Railway. De spoorweg, in samenwerking met de California Central Railway, bouwde een spoorlijn tussen Los Angeles en San Diego, met een station in Capistrano. Het station kreeg aanvankelijk de naam San Juan by the Sea, maar werd in 1910 veranderd in Serra, de naam van het nieuw gevormde schooldistrict.
De ontwikkeling van Capistrano Beach begon in 1925 met woonhuizen op de bluf. De Capistrano Beach Club werd gebouwd langs de oever van de nieuwe ontwikkeling. In 1929 werd de Petroleum Securities Company (eigendom van Edward L. Doheny) de nieuwe eigenaar van de ontwikkeling van Capistrano Beach. In 1931, na de dood van Doheny’s zoon, schonk hij meer dan 40 acres (16 ha) aan de staat voor Doheny State Beach. Capistrano Beach werd in 1989 onderdeel van de stad Dana Point.
Tijdens het afgraven van het land tijdens de ontwikkeling werden in 2016 de botten van een mastodont (of mogelijk een mammoet) ontdekt.
De 1.180 feet (360 m) houten pier is populair om te wandelen, sightseeing, en vissen. De pier werd in 1964 zwaar beschadigd door golven, waarna hij in 1965 werd afgekeurd en gesloopt. De Capistrano Beach Club raakte in verval en werd eind jaren ’60 ontmanteld.
Tijdens stormen in 2018 stortte een promenade in en werd een buitenbasketbalveld zwaar beschadigd nadat het ondermijnd was door erosie veroorzaakt door de golven. De storm legde oude auto’s bloot die daar decennia eerder waren neergezet als onderdeel van een nu gecorrodeerde zeewering. Er werden meer keien geplaatst om het beschadigde basketbalveld te beschermen.