Wanneer meerdere chemicaliën op hetzelfde oppervlak worden aangebracht zonder volledige verwijdering van de vorige stof, kunnen de chemicaliën op elkaar inwerken. Deze interactie kan de efficiëntie van de toegepaste chemicaliën verminderen (zoals een verandering in de pH-waarde door het mengen van alkaliën en zuren) en kan in sommige gevallen zelfs giftige dampen afgeven. Een voorbeeld hiervan is de vermenging van ammoniakhoudende reinigingsmiddelen (of zure reinigingsmiddelen) en bleekwater. Dit veroorzaakt de productie van chlooramines die vervluchtigen (gasvormig worden) en een acute ontsteking van de longen (toxische longontsteking), langdurige ademhalingsschade en mogelijk de dood veroorzaken.
Het is aangetoond dat residu van schoonmaakmiddelen en schoonmaakactiviteiten (afstoffen, stofzuigen, vegen) de luchtkwaliteit binnenshuis (IAQ) verslechteren doordat stofdeeltjes (stof, vuil, menselijke huidcellen, organisch materiaal, huidschilfers van dieren, verbrandingsdeeltjes, vezels van isolatie, pollen en polycyclische aromatische koolwaterstoffen) opnieuw worden verspreid, waaraan gasvormige of vloeibare deeltjes kunnen worden geadsorbeerd. De concentratie van dergelijke zwevende deeltjes en chemische residuen zal onmiddellijk na de reiniging het hoogst zijn, en zal na verloop van tijd afnemen, afhankelijk van de verontreinigingsniveaus, de luchtverversingssnelheid, en andere bronnen van chemische residuen. Het meest zorgwekkend is de familie van chemische stoffen die VOC’s worden genoemd, zoals formaldehyde, tolueen en limoneen.
Vluchtige organische stoffen (VOC’s) komen vrij uit veel huishoudelijke schoonmaakmiddelen, zoals desinfecterende middelen, boenwas, vloerwas, luchtverfrissersprays, allesreinigersprays en glasreinigers. Het is aangetoond dat deze producten irriterende dampen afgeven. VOC’s hebben de neiging te verdampen en vervolgens in de longen te worden ingeademd of te worden geadsorbeerd door stof, dat ook kan worden ingeademd. In aërosolvorm (verstuiving) gebrachte schoonmaakmiddelen zijn belangrijke risicofactoren en kunnen de symptomen van astma bij volwassenen, irritatie van de luchtwegen, astma bij kinderen, piepende ademhaling, bronchitis en allergie verergeren.
Andere manieren van blootstelling aan mogelijk schadelijke huishoudelijke schoonmaakmiddelen zijn absorptie door de huid (dermis), accidentele inslikken en accidenteel spatten in de ogen. Er zijn ook producten beschikbaar voor de toepassing en het veilige gebruik van de chemicaliën, zoals nylon scrubsponsjes en rubberen handschoenen. Het is aan de consument om zich veilig te gedragen bij het gebruik van deze chemicaliën. Het lezen en begrijpen van de etiketten is belangrijk.
De chemicaliën die worden gebruikt voor het schoonmaken van toiletten, gootstenen en badkuipen kunnen in het rioolwater terechtkomen en kunnen vaak niet effectief worden verwijderd of gefilterd.
Er is een groeiende belangstelling van consumenten en de overheid voor natuurlijke schoonmaakproducten en groene schoonmaakmethoden. Het gebruik van niet-giftige huishoudchemicaliën neemt toe naarmate consumenten meer te weten komen over de gezondheidseffecten van veel huishoudchemicaliën, en gemeenten te maken krijgen met de dure verwijdering van huishoudelijk gevaarlijk afval (HHW).