Choroba bakteryjna, którakolwiek z wielu chorób wywoływanych przez bakterie. Do połowy XX wieku bakteryjne zapalenie płuc było prawdopodobnie główną przyczyną śmierci wśród osób starszych. Lepsze warunki sanitarne, szczepionki i antybiotyki zmniejszyły śmiertelność spowodowaną infekcjami bakteryjnymi, chociaż szczepy odporne na antybiotyki spowodowały nawrót niektórych chorób. Na początku XXI wieku gruźlica, wywoływana przez Mycobacterium tuberculosis – której kilka szczepów rozwinęło oporność na jeden lub więcej leków szeroko stosowanych w leczeniu zakażenia – była jedną z najbardziej śmiertelnych chorób zakaźnych na świecie.
Bakterie powodują choroby poprzez wydzielanie lub wydalanie toksyn (jak w botulizmie), poprzez wytwarzanie toksyn wewnętrznie, które są uwalniane, gdy bakterie rozpadają się (jak w tyfusie), lub poprzez wywoływanie wrażliwości na ich właściwości antygenowe (jak w gruźlicy). Inne poważne choroby bakteryjne to cholera, błonica, bakteryjne zapalenie opon mózgowych, tężec, choroba z Lyme, rzeżączka i kiła.