W 1912 roku Roy E. Farmer założył małą firmę zajmującą się paleniem ziaren kawy i sprzedawaniem ich od drzwi do drzwi w Los Angeles w Kalifornii. Po dekadzie sukcesów, w 1923 roku Farmer założył spółkę, jednocześnie rozszerzając zakres działalności firmy o sprzedaż sprzętu do kawy, co zostało zaznaczone poprzez przejęcie Western Urn Manufacturing. Wraz z rozwojem firmy, zaczęto otwierać oddziały w całej Kalifornii, szybko zaznaczając swoją obecność w rozwijającym się San Francisco. Począwszy od lat 30-tych, Farmer Brothers rozwinęli swoją działalność o sprzedaż i dystrybucję nie tylko kawy ziarnistej i sprzętu, ale także szerszego asortymentu artykułów gastronomicznych.
Gdy Roy E. Farmer zmarł w 1951 roku w wieku 59 lat, jego syn, Roy F. Farmer przejął kontrolę nad firmą. Zmiana okazała się trudna dla firmy, ponieważ młodszy Farmer został zmuszony do upublicznienia firmy w 1952 roku. Gdy Roy F. się ustatkował, udało mu się znacznie poprawić wydajność produkcji i zwiększyć marże zysku. W kolejnych latach sprawowania przez Roya F. Farmera funkcji prezesa, dyrektora generalnego i prezydenta, firma osiągnęła w 1998 roku szczytowy poziom sprzedaży wynoszący 240 milionów dolarów. W tym momencie firma posiadała prawie 100 oddziałów w 29 stanach w zachodniej części USA. W tym samym czasie firma pogrążyła się jednak w niepokojach akcjonariuszy, którzy domagali się większej przejrzystości działań firmy i jej strategii rynkowej, chcieli, aby kadra kierownicza współpracowała z analitykami z Wall Street, a także domagali się dodania do zarządu niezależnych dyrektorów. Mimo to firma pozostała dość prywatna i zamknięta dla opinii publicznej. W chwili śmierci Roya F. Farmera po ponad 50 latach kierowania firmą (miał 87 lat) nie wyznaczono jeszcze jego następcy.
W latach po śmierci Farmera Guenter Berger pełnił funkcję dyrektora naczelnego, a Roy E. Farmer opuścił na pewien czas firmę. Jakiś czas później, Roger M. Laverty III został powołany jako dyrektor generalny i prezes, a w czasie jego kadencji jako dyrektor naczelny, Farmer Brothers nabył Coffee Bean International i Direct Store Delivery kawy biznes Sara Lee. Późniejsze przejęcie było za podobno 45 milionów dolarów. Funkcję tę pełnił do kwietnia 2011 roku. W tym momencie Jeffrey Wahba (skarbnik i dyrektor finansowy) i Patrick Criteser (prezes i dyrektor generalny Coffee Bean International) zostali mianowani przez radę nadzorczą jako współ-dyrektorzy na zasadzie tymczasowości.
W marcu 2012 roku, firma mianowała nowego dyrektora generalnego i prezesa, Michaela Keown. Keown przyszedł do firmy z WhiteWave Foods, spółki zależnej Dean Foods Company. Następnie w dniu 15 kwietnia 2013 r., Farmer Bros. mianował Marka Nelsona jako nowego CFO.
W dniu 28 kwietnia 2015 r., Farmer Brothers ogłosił, że będą przenosić swoją siedzibę z Torrance do Northlake, Texas, aby zaoszczędzić około $ 12-$15 mln rocznie. Prezes i dyrektor generalny Mike Keown powiedział: „Przeniesiemy siedzibę naszej firmy do najnowocześniejszego obiektu w miejscu centralnym dla naszej ogólnokrajowej bazy klientów i zapewnimy dodatkowe zdolności produkcyjne, aby wspierać przyszły wzrost.” Nowa siedziba w Northlake ma zostać otwarta w 2016 roku i przyniesie 300 nowych miejsc pracy, stając się największym pracodawcą w Northlake.
W 2016 roku Farmer Brothers nabył Boyd’s Coffee.
.