Épidémiologie descriptive de la fièvre de Lassa au Nigeria, 2012-2017

Épidémiologie descriptive de la fièvre de Lassa au Nigeria, 2012-2017

Onyebuchi Augustine Okoro1,&, Eniola Bamgboye2, Chioma Dan-Nwafor3, Chukwuma Umeokonkwo4, Elsie Ilori3, Rimamdeyati Yashe3, Muhammad Balogun5, Patrick Nguku5, Chikwe Ihekweazu3

1Nigeria Field Epidemiology and Laboratory Training Program, Abuja, Nigeria, 2Département d’épidémiologie et de statistiques médicales, Université d’Ibadan, Ibadan, Nigeria, 3Nigeria Centre for Disease Control, Abuja, Nigeria, 4Département de médecine communautaire, Alex Ekwueme Federal University Teaching Hospital Abakaliki, Ebonyi State, Nigeria, 5African Field Epidemiology Network, Bureau national du Nigeria, Abuja, Nigeria

&Auteur correspondant
Onyebuchi Augustine Okoro, Programme de formation en épidémiologie de terrain et en laboratoire du Nigeria, Abuja, Nigeria

La fièvre de Lassa est une fièvre hémorragique virale causée par un virus à ARN monocaténaire appartenant à la famille des Arenaviridae, c’est une zoonose dont le réservoir est le rat multimammé du genre Mastomys . Les humains sont infectés par l’exposition à des aliments ou à des articles ménagers contaminés par les excréments ou l’urine de rongeurs infectés, par la transformation de rats infectés en vue de leur consommation, par l’inhalation de minuscules particules dans l’air contaminé par des excrétions de rongeurs infectés ou par la réutilisation d’aiguilles infectées. La transmission de personne à personne se produit également, en particulier chez les travailleurs de la santé, par contact direct avec les fluides corporels de personnes infectées, souvent en raison de l’absence de mesures appropriées de prévention et de contrôle de l’infection (IPC) lors des soins. La fièvre de Lassa a été découverte pour la première fois en 1969 au Nigeria, après le décès de deux infirmières missionnaires dans la ville de Lassa, dans l’État de Borno. La maladie est endémique dans les pays d’Afrique de l’Ouest que sont la Sierra Leone, le Liberia, la Guinée et le Nigeria, où l’on enregistre chaque année entre 300 000 et 400 000 cas et environ 5 000 décès. Des cas ont également été signalés en République centrafricaine, en République démocratique du Congo, au Mali et au Sénégal. Les cas de fièvre de Lassa sont difficiles à différencier des autres maladies fébriles et, s’ils ne sont pas bien pris en charge, ils peuvent entraîner des taux de mortalité élevés. Au Nigeria, la fièvre de Lassa est l’une des sept maladies à déclaration obligatoire à tendance épidémique qui doivent être signalées dans le cadre du système intégré de surveillance des maladies (IDSR). Un cas suspect est considéré comme un seuil d’alerte et un cas confirmé comme un seuil épidémique. Des épidémies sporadiques se produisent chaque année et ont été signalées dans près d’un tiers des États du pays. Il y a cependant peu de publications sur l’ampleur de la maladie dans le pays. Cela pourrait affecter la préparation précoce et l’allocation des ressources qui contribuent au contrôle de la maladie. Cette étude a donc été menée pour décrire épidémiologiquement les infections de la fièvre de Lassa mettant en évidence l’ampleur de la maladie au Nigeria sur une période de six ans.

Cadre de l’étude : Le Nigeria compte 36 États et un territoire de la capitale fédérale (FCT) avec 774 zones de gouvernement local (LGA) et est principalement catégorisé en six régions géopolitiques (Sud-Est, Sud-Sud, Sud-Ouest, Centre-Nord, Nord-Ouest et Nord-Est). Le pays connaît deux saisons distinctes, dont la saison des pluies qui commence entre mars et mai et se termine entre septembre/novembre, selon les régions. La saison sèche commence en octobre/décembre et se termine en avril et peut se prolonger jusqu’en mai/juin dans d’autres régions. La surveillance de la fièvre de Lassa au Nigeria se fait par le biais de la plateforme IDSR. Les informations circulent depuis les établissements de santé, par l’intermédiaire des personnes de contact des districts, jusqu’aux agents de surveillance et de notification des maladies (DSNO) des zones de gouvernement local (LGA), aux DSNO des États, puis au ministère fédéral de la santé (Centre nigérian de contrôle des maladies) par l’intermédiaire de l’épidémiologiste de l’État. Le retour d’information se fait dans le sens inverse. Tous les États du Nigeria, y compris le FCT, font des rapports par le biais de l’IDSR.

Modèle d’étude et population : des analyses de données secondaires des enregistrements IDSR spécifiques à la fièvre de Lassa au Nigeria de 2012 à 2017 ont été réalisées. La liste des lignes de données épidémiologiques hebdomadaires IDSR pour les années étudiées a été obtenue auprès du département de surveillance et d’épidémiologie du Centre de contrôle des maladies du Nigeria (NCDC). Les variables rapportées étaient l’état de résidence, et la classification de la fièvre de Lassa basée sur le diagnostic de laboratoire (suspecté, confirmé).

Définitions des cas de fièvre de Lassa de l’IDSR : un cas suspect a été défini comme toute personne présentant une maladie d’apparition progressive avec un ou plusieurs des éléments suivants : malaise, fièvre, maux de tête, mal de gorge, toux, nausées, vomissements, diarrhée, myalgie (douleur musculaire), douleur thoracique centrale ou douleur rétrosternale, perte auditive et soit des antécédents de contact avec des excréments ou des urines de rongeurs, soit des antécédents de contact avec un cas probable ou confirmé de fièvre de Lassa dans un délai de 21 jours après le début des symptômes, soit toute personne présentant des saignements inexplicables. Un cas probable a été défini comme tout cas suspect tel que défini ci-dessus mais qui est décédé ou a pris la fuite sans que des échantillons aient été prélevés pour des tests de laboratoire et un cas confirmé comme tout cas suspect avec confirmation en laboratoire (anticorps IgM positifs, PCR ou isolement du virus). Les définitions étaient conformes à la ligne directrice du NCDC pour la gestion de la fièvre de Lassa.

Gestion des données : nous avons trié, extrait et nettoyé les données pertinentes sur le nombre de cas, la localisation et les résultats de laboratoire (positifs ou négatifs). Nous avons examiné les données pour vérifier leur exhaustivité. Nous avons calculé les fréquences et les proportions en utilisant Microsoft Excel 2016, les cartes ont été générées avec le logiciel Quantum Geographic Information System (QGIS).

Considérations éthiques : l’approbation a été reçue du département de surveillance et d’épidémiologie du Centre de contrôle des maladies du Nigeria.

Un total de 5 974 cas a été signalé entre janvier 2012 et décembre 2017, sur ce nombre, 759 (12,7%) étaient des cas confirmés. Le plus grand nombre de cas 1723 (28,8%) a été signalé en 2012, suivi par 2013 avec 1195 (20,0%). Le nombre le plus faible de cas, 428 (7,2 %), a été signalé en 2015 (figure 1). Sur l’ensemble des cas confirmés, les États de la région sud ont été plus touchés, tous les États de la région sauf Bayelsa, Imo et Cross River ayant signalé au moins un cas confirmé. Les États d’Edo et d’Ondo ont signalé le plus grand nombre de cas (> 50 cas confirmés). Plus d’états de la région Nord n’ont pas eu de cas confirmé au cours de la période d’étude (figure 2). La tendance des cas de fièvre de Lassa a montré un modèle mais n’était pas cohérente tout au long de la période de six ans. Les cas ont atteint un pic entre janvier et mars chaque année, sauf en 2015 et 2016 où les cas ont atteint un pic en mai et décembre respectivement. Il y avait également une occurrence des cas presque toute l’année au cours de la période de six ans (figure 3).

Notre étude montre une magnitude élevée de la maladie de la fièvre de Lassa au Nigeria, en particulier dans la partie sud du pays, le nombre élevé de cas confirmés signalés au cours de la période d’étude de six ans soulève des inquiétudes compte tenu de la morbidité et de la mortalité élevées associées aux infections de la fièvre de Lassa, en particulier en l’absence de diagnostic précoce et de gestion appropriée. Nos résultats corroborent les rapports antérieurs sur l’endémicité de la fièvre de Lassa en Afrique de l’Ouest, y compris au Nigeria. Le nombre élevé de cas en provenance d’Edo et d’Ondo pourrait être dû soit à la présence du réservoir dans les États, soit à des pratiques culturelles et environnementales, comme le séchage des aliments à l’extérieur, en plus de la présence d’un centre de traitement majeur dans l’État d’Edo où la plupart des cas de fièvre de Lassa du pays sont pris en charge. L’échelonnement des pics d’apparition des cas confirmés et la présence de cas presque toute l’année au cours de la période d’étude de six ans suggèrent qu’il ne faut pas se fier uniquement aux rapports antérieurs sur la variation saisonnière de l’apparition des cas pour les activités de préparation. Cela corrobore également les rapports documentés selon lesquels les épidémies de fièvre de Lassa peuvent survenir à tout moment de l’année. Il est donc nécessaire de maintenir un indice de suspicion élevé parmi les travailleurs de la santé , de développer et de maintenir un plan national de préparation aux épidémies et d’intensifier les activités de communication des risques.

Géographiquement, notre étude montre une propagation des cas dans 26 États du pays et dans toutes les régions géopolitiques. Cela diffère des rapports d’autres études où les cas ont été signalés dans moins d’États que ce que nous avons trouvé . La répartition des cas dans plusieurs États, y compris ceux qui partagent des frontières avec d’autres pays, suggère un risque de transmission transfrontalière et constitue une menace pour la sécurité sanitaire mondiale. Il est donc nécessaire de collaborer avec d’autres organismes pour gérer l’épidémie de fièvre de Lassa et de partager les informations entre les pays afin de minimiser le risque de propagation internationale. L’État d’Edo a constamment enregistré le plus grand nombre de cas au cours de la période d’étude de six ans, ce qui pourrait être dû à la présence d’un centre de traitement majeur dans l’État, ce qui pourrait inciter les patients à se faire soigner dans le centre sans notifier leur État d’origine, comme le recommande le système IDSR. Cela peut également être dû à la présence de réservoirs ou à des pratiques culturelles en matière de traitement et de conservation des aliments. La proportion élevée de cas dans la région sud par rapport à la région nord appelle à des recherches plus approfondies sur l’écologie du virus de Lassa, en particulier si l’on considère que le premier cas de fièvre de Lassa rapporté dans le pays provenait de la région nord et que le séquençage génétique d’échantillons positifs de fièvre de Lassa de 2018 n’a révélé aucune modification du génome viral ou des schémas de transmission. Limites : cette étude a été alourdie par plusieurs limites de l’analyse des données secondaires, notamment l’absence de certaines variables qui auraient pu aider à effectuer une analyse descriptive complète. De plus, les données n’étaient pas spécifiques sur les classifications de cas, il n’y avait pas d’enregistrements de cas probables et de résultats diagnostiques pour tous les cas rapportés.

Notre étude a montré une ampleur croissante de la fièvre de Lassa au Nigeria avec une endémicité dans la plupart des États du sud du pays, il est donc nécessaire de redéfinir le niveau de seuil de la maladie à travers les États, de développer et d’instituer des plans de préparation aux niveaux national et infranational et d’établir plus d’installations de diagnostic et de traitement avec une main-d’œuvre compétente dans les six géorégions du pays.

Les auteurs ne déclarent aucun intérêt concurrent.

Tous les auteurs ont immensément contribué au contenu du manuscrit et ont tous lu la version finale. OAO, EB, CDN, CU, EI, RY, MB, PN et CI ont conçu le travail et analysé les données. L’OAO et CDN ont nettoyé les données. OAO, EB, CU, RY, CDN ont rédigé la première version de l’article. CI, EB, EI, PN, MB, CDN et CU ont relu la version finale. Tous les auteurs ont lu et approuvé la version finale de ce manuscrit et ont contribué à parts égales à son contenu.

Nous remercions le groupe de travail technique sur la fièvre de Lassa du Centre de contrôle des maladies du Nigeria, Abuja pour avoir aidé les auteurs à nettoyer les données et à conceptualiser initialement le sujet, nous remercions également le Nigeria Field Epidemiology and Laboratory Training Program pour avoir fourni des conseils sur la rédaction du manuscrit à l’un des auteurs.

Figure 1 : distribution annuelle des cas de fièvre de Lassa au Nigeria, 2012-2017
Figure 2 : distribution des cas confirmés de fièvre de Lassa au Nigeria, 2012-2017
Figure 3 : tendance mensuelle des cas confirmés de fièvre de Lassa au Nigeria, 2012-2017

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