Le port de Port Jefferson, sur la rive sud de Long Island Sound à l’est de Old Field Point, est accessible par un chenal dragué qui mène entre deux jetées en ruine à une zone d’accostage près de l’extrémité sud-ouest du port ; les jetées sont chacune signalées par un feu. L’approche est marquée par une bouée à sifflet lumineuse, à environ 1,1 mille au nord-ouest de l’entrée. Trois cheminées sur le côté ouest, près de la tête du port, sont des points de repère bien visibles. Une limite de vitesse de 12 mph est appliquée dans le chenal d’entrée principal, et une limite de vitesse de 5 mph est appliquée à la tête du port à proximité des zones d’amarrage et des quais.
Il existe des installations pour les petites embarcations à la tête du port. Une rampe de mise à l’eau se trouve à la tête du port.
Setauket Harbor dispose d’essence, d’amarrages et des fournitures marines limitées sont disponibles au chantier naval ; une remorque à plateau peut tracter des embarcations jusqu’à 32 pieds de long.
L’approche de Port Jefferson Harbor est dégagée, en prenant soin d’éviter le haut-fond Mount Misery Shoal avec des profondeurs de 7 à 12 pieds, à environ 0,8 mile au nord-nord-est du feu de la jetée est.
Un projet fédéral prévoit un canal de 26 pieds de profondeur depuis Long Island Sound jusqu’à l’extrémité sud de Port Jefferson Harbor. Le canal est balisé par des bouées lumineuses et non lumineuses et une portée lumineuse de 146°. En 1982, il a été signalé qu’en raison de la proximité des feux d’alignement, il peut être difficile de déterminer quand ils sont alignés. Il a également été signalé que l’alignement peut être obscurci par les navires amarrés au quai pétrolier du côté ouest du port.
Des hauts-fonds peu profonds se trouvent des deux côtés du chenal, de l’entrée de Port Jefferson à la bouée lumineuse 5 à l’intérieur de l’entrée. Le sol de la jetée est à la bouée à cloche lumineuse est brisé, avec des hauts-fonds couverts de 4 à 11 pieds. La bouée à cloche lumineuse ne peut pas être vue par-dessus le brise-lames à marée basse par les petits navires qui s’approchent du port.
Port Jefferson Harbor est entré par un canal dragué qui mène entre deux jetées qui sont en ruines à une zone d’accostage près de l’extrémité sud-ouest du port ; les jetées sont chacune marquées par un feu. L’approche est marquée par une bouée à sifflet lumineuse, à environ 1,1 mille au nord-ouest de l’entrée. Deux cheminées sur le côté ouest, près de la tête du port, sont des points de repère bien visibles.
Un mille nautique mesuré à 121°-301° se trouve à l’ouest de l’entrée du port de Port Jefferson, sur la plage d’Old Field. Les balises avant sont des poteaux orange d’environ 8 pieds de haut ; les balises arrière sont des rectangles montés sur des pieds d’environ 12 pieds de haut, peints en rouge avec une bande verticale noire de 6 pouces au milieu.
Setauket Harbor, sur le côté ouest de Port Jefferson Harbor, a un canal étroit et tortueux. En 1981, une profondeur signalée d’environ 2½ pieds était disponible dans le canal vers le chantier naval de Setauket. L’entrée depuis Port Jefferson est marquée par des bouées saisonnières privées.