Définition du règne
Dans l’étude de la taxonomie, le rang du règne est juste en dessous du domaine, comme on le voit sur l’image ci-dessous. Toute la vie, que l’on pense provenir d’une seule origine, peut être décomposée en niveaux inférieurs de classification, comme un royaume ou un phylum. Chaque niveau consécutif représente un groupe d’organismes plus apparentés. Cette structure a évolué, passant d’un taxon de quelques royaumes avec 3 ou 4 divisions inférieures à un royaume, deuxième division la plus élevée, comportant 6 divisions. Cela permet de tenir compte du nombre croissant d’espèces reconnues et de notre compréhension de la façon dont elles sont liées.
Les quatre règnes communément reconnus sont Protista, Animalia, Plantae et Fungi. Les bactéries et les archées sont parfois regroupées dans un seul royaume, les Monera, et parfois dotées de leur propre royaume distinct. Si l’on considère qu’elles appartiennent à des domaines distincts, il convient de leur attribuer des règnes distincts afin de refléter la structure de la hiérarchie taxonomique. Cependant, certains scientifiques se sont opposés à l’héritier taxonomique, affirmant qu’il ne reflète pas précisément les relations entre les organismes.
Histoire du royaume en taxonomie
Carl Linnaeus a utilisé le terme pour la première fois dans les années 1700 pour décrire les ordres les plus élevés de la vie. Les deux principaux groupes de vie, tels qu’il les voyait, étaient le royaume Plantae et le royaume Animalia. La microbiologie et la génétique modernes ont révélé une image bien différente. Dans les années 1990, il était généralement admis que toute la vie devait d’abord être divisée en trois domaines. Ces domaines, Bactéries, Archées et Eucaryotes, représentent des différences fondamentales dans la structure, la formation et la survie des cellules. Comme on peut le voir ci-dessous, chaque grand règne peut s’inscrire dans ces domaines, dont on pense qu’ils ont tous un ancêtre commun.
Certains des taxons représentés ici sont en fait des phylum, et ne représentent pas un règne entier. Les progrès de la cladistique et de la génétique ont révélé que certains phylum individuels étaient plus proches d’un royaume. Comme nous le verrons plus loin, cela a conduit à des changements dans la façon dont nous décrivons et voyons un royaume. Au fil du temps, de nombreuses versions différentes ont évolué depuis la première taxonomie de Linné. Dans les années 1800, les scientifiques ont finalement reconnu les protistes et d’autres organismes unicellulaires dans leur propre royaume, et ont séparé le royaume des champignons de celui des plantes. Plus récemment, des preuves génétiques ont révélé que les bactéries et les protistes contiennent une énorme variété de génétique et d’adaptations.
Ceci a suscité le système à 3 domaines, qui est généralement accepté aujourd’hui. Cependant, des études sont continuellement menées sur la légitimité des royaumes et de leur organisation. Certaines d’entre elles découlent de nouveaux développements et études qui viennent compléter le tableau. Cet ajout constant d’informations réforme continuellement la taxonomie et, à ce titre, la définition et la portée du terme » royaume » changent constamment.
Problèmes avec les royaumes
Idéalement, chaque royaume serait un groupe monophylétique, composé d’un ancêtre commun et de tous les descendants, existants et éteints. Tout d’abord, il est impossible de savoir si tous les organismes éteints ont été retrouvés, et selon toute vraisemblance, ils ne l’ont pas été. Cela crée de grandes zones de doute lors de la construction des phylogénies, ou arbres de vie. Considérez le schéma ci-dessous, qui présente probablement une représentation assez précise de la vie telle que nous la connaissons.
Vous verrez que les différentes branches sont bien définies, mais que toutes les branches ont des racines les unes dans les autres. Définir un royaume, dans cette optique, devient très difficile. Sans connaissance directe des ancêtres communs, où tracez-vous la ligne entre Protista et Fungi, par exemple ? En outre, le terme « royaume » étant plus ou moins arbitraire, où se situe la limite entre un domaine et un royaume ? Les bactéries et les archées sont toutes deux considérées comme des domaines, tandis que les autres embranchements appartiennent à l’Eucarya. C’est aux taxonomistes et aux experts en phylogénie d’essayer de comprendre les relations fondamentales et parfois cachées entre ces règnes et ces domaines.
De nombreux scientifiques ont fait valoir que les termes eux-mêmes sont devenus arbitraires et pesants. Avec la révolution technologique, les ordinateurs ont été en mesure de faire des phylogénies de plus en plus précises. Certains soutiennent que nous devrions essentiellement supprimer l’ancien système et créer une nouvelle définition du royaume et d’autres termes taxonomiques qui ne représentent que des groupements monophylétiques tels que nous les acceptons actuellement.
Quiz
1. Quelle est la différence entre un royaume et un phylum ?
A. Un royaume comprend plus d’organismes
B. Le royaume se situe à un niveau taxonomique plus élevé
C. Il n’y a pas de différence entre les deux termes
2. Pourquoi certains scientifiques s’opposent-ils à la structure hiérarchique classique de la taxonomie ?
A. Elle est basée historiquement sur l’observation visuelle uniquement, laissant de nombreux animaux mal classés
B. Sur la base de preuves génétiques, certains royaumes ne représentent pas tous les descendants et un ancêtre commun
C. Toutes ces réponses
3. En vous promenant dans votre jardin, vous découvrez une petite souris. À quel règne appartient la souris ?
A. Mammalia
B. Animalia
C. Mus