Le traitement traditionnel de l’infection à H. pylori consiste en 10 jours à 2 semaines d’un ou deux antibiotiques efficaces, comme l’amoxicilline, la tétracycline (à ne pas utiliser chez les enfants <12 ans.), le métronidazole ou la clarithromycine, plus soit la ranitidine citrate de bismuth, le subsalicylate de bismuth, soit un inhibiteur de la pompe à protons. La suppression de l’acidité par le bloqueur H2 ou l’inhibiteur de la pompe à protons en conjonction avec les antibiotiques aide à soulager les symptômes liés à l’ulcère (c’est-à-dire les douleurs abdominales, les nausées), aide à guérir l’inflammation de la muqueuse gastrique et peut améliorer l’efficacité des antibiotiques contre H. pylori à la surface de la muqueuse gastrique. Actuellement, huit schémas thérapeutiques contre H. pylori sont approuvés par la Food and Drug Administration (FDA) (tableau 1) ; toutefois, plusieurs autres combinaisons ont été utilisées avec succès. La résistance aux antibiotiques et la non-conformité du patient sont les deux principales raisons de l’échec du traitement. Les taux d’éradication des huit schémas thérapeutiques approuvés par la FDA varient de 61 % à 94 % selon le schéma utilisé. Globalement, les régimes de trithérapie ont montré de meilleurs taux d’éradication que la bithérapie. Une durée de traitement plus longue (14 jours contre 10 jours) entraîne de meilleurs taux d’éradication.
De nombreux remèdes naturels ont également été suggérés et ont montré leur efficacité. Par exemple, une étude japonaise d’avril 2009 a révélé que le brocoli est un remède naturel efficace de la bactérie H. pylori. On pense que les sulforphanes présents dans les pousses de brocoli ont des propriétés antimicrobiennes. En 1998, une étude israélienne a révélé que des extraits de cannelle empêchaient les enzymes uréases de catalyser les réactions dans les cellules de H. pylori. Plusieurs autres substances ont été proposées pour contrer H. pylori, notamment des herbes comme l’ail et le gingembre, des huiles comme l’huile de coco et l’huile d’origan et le vinaigre de cidre de pomme.