Nel 1912, Roy E. Farmer iniziò una piccola attività di torrefazione di chicchi di caffè e di vendita porta a porta a Los Angeles, California. Dopo un decennio di successo, Farmer si è incorporato nel 1923 e contemporaneamente ha ampliato la portata della società per includere la vendita di attrezzature per il caffè, segnata dall’acquisizione della Western Urn Manufacturing. Mentre l’azienda cresceva, cominciarono ad aprire filiali in tutta la California, stabilendo rapidamente una notevole presenza nello sviluppo di San Francisco. A partire dagli anni ’30, Farmer Brothers si diversificò per includere la vendita e la distribuzione non solo di chicchi di caffè e attrezzature, ma una più ampia selezione di articoli di supporto per la ristorazione.
Quando Roy E. Farmer morì nel 1951 all’età di 59 anni, suo figlio, Roy F. Farmer assunse il controllo della società. La transizione si rivelò difficile per l’azienda, dato che il giovane Farmer fu costretto a portare l’azienda in borsa nel 1952. Con l’insediamento di Roy F. fu in grado di migliorare notevolmente l’efficienza della produzione e aumentare i margini di profitto. Negli anni successivi del mandato di Roy F. Farmer come presidente, amministratore delegato e presidente, l’azienda raggiunse un picco di 240 milioni di dollari di vendite nel 1998. A questo punto, l’azienda aveva quasi 100 filiali in 29 stati degli Stati Uniti occidentali. In questo stesso periodo, tuttavia, l’azienda si impantanò in un’agitazione degli azionisti; gli azionisti chiedevano una maggiore trasparenza nelle operazioni dell’azienda e nella strategia di mercato, volevano che i dirigenti lavorassero con gli analisti di Wall Street e volevano che fossero aggiunti al consiglio direttori indipendenti. Nonostante questo, l’azienda rimase abbastanza privata e chiusa al pubblico. Al momento della morte di Roy F. Farmer, dopo più di 50 anni alla guida della società (aveva 87 anni), non era stato nominato un successore.
Negli anni successivi alla morte di Farmer, Guenter Berger servì come amministratore delegato e Roy E. Farmer lasciò la società per un certo periodo. Qualche tempo dopo, Roger M. Laverty III fu nominato amministratore delegato e presidente e durante il suo periodo come amministratore delegato, Farmer Brothers acquisì Coffee Bean International e il business del caffè Direct Store Delivery di Sara Lee. L’ultima acquisizione è stata per 45 milioni di dollari. Ha servito fino ad aprile 2011. A quel punto, Jeffrey Wahba (Tesoriere e CFO) e Patrick Criteser (Presidente e CEO di Coffee Bean International) sono stati nominati dal consiglio come co-CEO ad interim.
Nel marzo 2012, la società ha nominato un nuovo CEO e Presidente, Michael Keown. Keown è arrivato in azienda da WhiteWave Foods, una filiale di Dean Foods Company. Poi il 15 aprile 2013, Farmer Bros. ha nominato Mark Nelson come suo nuovo CFO.
Il 28 aprile 2015, Farmer Brothers ha annunciato che sposteranno la loro sede da Torrance a Northlake, Texas per risparmiare circa $12-$15 milioni all’anno. Il presidente e amministratore delegato Mike Keown ha detto: “Trasferiremo la nostra sede aziendale in una struttura all’avanguardia in una posizione centrale per la nostra base di clienti a livello nazionale e forniremo una capacità produttiva incrementale per sostenere la crescita futura.” La nuova sede di Northlake dovrebbe aprire nel 2016 e porterà 300 nuovi posti di lavoro, diventando il più grande datore di lavoro di Northlake.
Nel 2016, Farmer Brothers ha acquisito Boyd’s Coffee.