一連のミッションの中で15番目に位置するサンファン・バウティスタ・ミッションは、1797年6月24日にラスエン神父によって設立されました（ミッションの守護聖人である洗礼者ヨハネの祭日）。
ミッションが保存されているように、この街もまた魅力的です。スペインの街並みを模したミッションの周辺には、約30の歴史的な建物があり、ミッション時代の生活の様子を見ることができます。 サン・ファン・バウティスタ広場に建つミッション。 1814年に建てられたプラザホテルは、ミッションの兵舎として使われていました。 ゼネータ・ハウス（プラザ・ホール）は1868年に建てられました。
ミッション・サンファン・バウティスタは、不幸にもサンアンドレアス断層の上に位置しています。
ミッション・サンファン・バウティスタは、不幸にもサンアンドレアス断層の上にあり、1906年の地震で教会の外壁やその他の建物が破壊されました。
サン・ファン・バウティスタは、全ミッションの中で唯一の3廊式教会を誇ります。
サン・ファン・バウティスタは、全伝道部の中で唯一の3廊式教会です。1812年の地震で中央と側廊を分けるアーチが破壊されました。 その後、教父たちが2つの側廊を埋めました。
教会の大部分は1812年当時のままで、主祭壇のレレドやブルトスなどはほとんど修復されていません。
主祭壇のレレドスやブルトスはほとんど修復されていませんが、教会の床のタイルに注目してみると、外で天日干ししていたときにできた動物の足跡が残っています。 また、この教会には、ミッションチェーンの中で最大かつ最も充実した使徒職の絵画コレクションが展示されています
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