特筆すべきは、1999年にRosicrucian Egyptian Museumが巡回展 “Women of the Nile “を開始し、多くの講演が行われたことである。 “ナイルの女たち」は、アメリカとカナダを巡回し、2001年まで続きました。
薔薇十字博物館の子供のミイラは、2005年5月6日にパロアルト近郊のスタンフォード大学に移動し、博物館、シリコングラフィックス、スタンフォード大学病院、NASAバイオコンピューティングラボとの共同研究により、CTスキャンなどの高解像度のリモートセンシングによる研究が行われました。 その結果は、2005年8月6日に開催された博物館の75周年記念式典で、詳細なスキャン画像とともに発表されました。 スキャン画像の一つは、全米科学財団とScienceが共催する「Science and Engineering Visualization Challenge 2006」で優勝しました。 2017年11月には、少女の遺体を3Dで可視化したミイラのX線画像が公開されました。
かつては、古代エジプトのカバに似た妊婦と出産の女神タウェレトの像が入り口に立っていましたが、現在は横に移動しています。 2004年以降、博物館は全面的に改装され、以下のようなギャラリーテーマが設定されています：
- 死後の世界と岩窟墓
- 日常生活と他文化
- 王権と宮殿
- 神殿（セクメト）とアクエンアテンのアマルナ時代
- 回転展示。 2015年から 薔薇十字団の錬金術展
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エジプトの上流階級の男性のこと。
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第18王朝時代初期の 18王朝時代の棺桶
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ヒヒのミイラ。
この博物館には150万年前の石製のハンドアックスもありますが、一般には展示されていません。 信頼できるソースへの引用を追加して、このセクションの改善にご協力ください。 ソースのないものは、異議申し立てをして削除することがあります。 (2018年7月) (このテンプレートメッセージを削除する方法とタイミングを学ぶ)
薔薇十字団エジプト博物館には、お客様にそのような発掘現場にいるような体験をしていただくために、薔薇十字団がベニハサンの墓に遠征した際に撮影した写真やスケッチをもとに、古代エジプトの岩窟墓を複合的に再現したレプリカが設置されています。 下の写真は、「死者の書」の場面を中心とした墓のレプリカの内部の写真です。 墓のレプリカの内部が暗いことがわかる。
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The Rosicrucian Alchemy ExhibitEdit
このセクションはソースを引用していません。 信頼できるソースへの引用を追加して、このセクションの改善にご協力ください。 ソースのないものは、異議申し立てをして削除することがあります。 2018年7月）（Learn how and time to remove this template message）2015年から、当館を所有・運営するAMORC in Americaの法人化100周年を記念して、当館の「回転展示ギャラリー」は「薔薇十字の錬金術展」となりました。
錬金術師のデニス・ウィリアム・ハウク氏が監修したこの展示では、錬金術の7つの過程を辿ることができ、「哲学者のアゾート」と録音されたガイド付き瞑想を備えた瞑想室、錬金術師の作業場の実物大の再現などがあります。
この展示は、米国初、そして世界最大の錬金術博物館の核となるものです。
この展示品は、米国初、世界最大の錬金術博物館の核となるもので、Rosicrucian Parkにある現在の「Rose-Croix University International」の建物に収容されます。 RCUIビルには、現役の錬金術研究室もあります。