Pomidor to warzywo, którego droga przez historię nie była łatwa i wypełniona licznymi błędnymi przekonaniami i blokadami. W końcu w ciągu ostatnich kilku stuleci ta południowoamerykańska roślina zdołała rozprzestrzenić się po całym świecie, stając się jednym z najlepiej znanych składników żywności i jednym z najbardziej lubianych warzyw (mimo że technicznie jest klasyfikowana jako owoc). Hodowla selektywna zdołała przekształcić pomidora w bardzo pożywną odmianę, pełną witaminy A, C, E, przeciwutleniaczy i nie tylko.
Dokładne pochodzenie pomidora nie jest znane, choć spekuluje się, że wyewoluował on z prehistorycznej rośliny Nighshade ponad miliony lat temu w Ameryce Południowej (wraz z ziemniakiem, tytoniem i papryką chili) i powoli przemieszczał się na północ, aż został udomowiony na terenach Mezoameryki pomiędzy Meksykiem a północną Kostaryką. Ziemie te były domem kilku zaawansowanych prekolumbijskich społeczeństw, które kwitły tam aż do przybycia Europejczyków w Erze Odkryć. W 500 r. p.n.e. jednej z tych kultur udało się udomowić pomidora i włączyć go do swojej kuchni. Tą kulturą byli Aztekowie. Od tego momentu pomidor powoli rozprzestrzeniał się po Ameryce Środkowej i Południowej, gdzieś tam będąc wykorzystywany jako pożywienie, ale gdzieś tam również jako środek halucynogenny (zastosowanie, które później będzie przyczyną wielu nieporozumień dotyczących tego warzywa).
Pierwszy europejski kontakt z pomidorem miał Krzysztof Kolumb, który prawdopodobnie zetknął się z nim w 1493 r., ale to hiszpański konkwistador Hernán Cortés po raz pierwszy dostrzegł potencjał tej rośliny w splądrowanym azteckim mieście Tenochtítlan i zabrał jej nasiona z powrotem do Europy. Tam, widząc, że pomidor może bez problemu rosnąć w ciepłym klimacie śródziemnomorskim, rząd hiszpański zaczął zachęcać do jego produkcji zarówno w Europie, jak i w swoich odległych koloniach. Już w 1540 roku pomidor zaczął być produkowany na hiszpańskich polach, a na początku XVII wieku był regularnie używany jako powszechne pożywienie. Inne kraje europejskie nie przyjęły pomidora od razu. Na przykład, mimo że włoska szlachta i naukowcy dowiedzieli się o pomidorze w 1548 roku, (który jest teraz znany z ich przemysłu pomidorowego i ketchupu), używali go tylko jako owoc dekoracji blatu do końca 17 i początku 18 wieku. Pielęgnując jego piękno, eksperymentowali z selektywną hodowlą, dzięki czemu udało im się stworzyć pomidory o wielu kolorach i kształtach. Podobny los spotkał pomidora w Anglii, gdzie został wprowadzony w 1597 roku, ale zarówno w Anglii, jak i w jej północnoamerykańskich koloniach nadal był postrzegany jako niezdrowy, trujący i nienadający się do jedzenia. Zmieniło się to w połowie XVIII wieku po wielu postępach w selektywnej hodowli z Hiszpanii i Włoch.
Na początku XIX wieku pomidor dotarł wreszcie do Azji. Dotarł tam pod kierunkiem brytyjskiego konsula w Syrii Johna Barkera, który kierował pierwszymi próbami uprawy. W połowie XIX wieku pomidor zyskał dużą popularność i zaczął być szeroko wykorzystywany w Syrii, Iranie i Chinach.
Nowoczesna era pomidora uprawianego komercyjnie rozpoczęła się dzięki wysiłkom Alexandra W. Livingstona, amerykańskiego botanika i naukowca, który poświęcił znaczną część swojego życia na unowocześnienie pomidora poprzez selektywną hodowlę do najbardziej znanej formy, jaką znamy dzisiaj. W 1870 roku jego rasa o nazwie Paragon odniosła natychmiastowy sukces w Ameryce Północnej, dając początek dużemu przemysłowi pomidorowemu i aprobacie opinii publicznej.
W 2009 roku światowa produkcja pomidorów wzrosła do 158,3 mln ton, przewyższając poprzedni rok o 3,7%. Największymi producentami były Chiny z 24% udziałem w produkcji światowej, a następnie Stany Zjednoczone, Turcja, Indie, Egipt i Włochy.