As raposas voadoras na Austrália são conhecidas por serem portadoras de duas infecções que podem representar um sério risco para a saúde humana – o vírus australiano do morcego lyssavirus e o vírus hendra (Henipavirus). Estas doenças transmitidas por morcegos, exclusivas de Queensland, estão entre os vírus mais mortais do mundo ocidental. Embora raras, estas doenças continuam a mistificar os profissionais médicos. Estas doenças transmitidas por morcegos são quase sempre fatais. As infecções humanas com estes vírus são, felizmente, muito raras.
Vírus Hendra é um vírus que infecta principalmente megabats (grandes morcegos da fruta, ou “raposas voadoras”) que pode ser transmitido aos cavalos. Tal como o ébola e marburg, o hendra é uma febre hemorrágica com mortalidade elevada a muito elevada (50-90%). Tanto o ébola como o vírus marburgo têm sido associados aos megabatts como vectores infecciosos. Pensa-se que os cavalos contraem o vírus Hendra através da ingestão de alimentos ou água contaminada com fluidos corporais e excreções de megabatts infectados. O vírus pode ser mortal tanto para os seres humanos como para os cavalos. Quando não há manipulação ou contacto físico directo com raposas voadoras, há um risco insignificante para a saúde pública.
Apenas três pessoas são conhecidas por terem sobrevivido ao vírus Hendra transmitido por morcegos.Até agora, mais de metade de todas as pessoas que contraíram o vírus Hendra morreu no prazo de seis semanas, no entanto, não houve sobreviventes de uma segunda doença transmitida por morcegos em Queensland. Em 1994, o lyssavirus – um parente próximo do vírus da raiva – foi descoberto pela primeira vez numa raposa voadora com sintomas perto de Ballina, NSW (que se encontra na fronteira com Queensland). O lissavírus matou as únicas três pessoas que alguma vez o contraíram.