Terapia tradicional para a infecção por H. pylori consiste em 10 dias a 2 semanas de um ou dois antibióticos eficazes, tais como amoxicilina, tetraciclina (não deve ser usado para crianças <12 anos.), metronidazol, ou claritromicina, mais o citrato de ranitidina bismuto, subsalicilato de bismuto, ou um inibidor da bomba de protões. A supressão do ácido pelo bloqueador de H2 ou inibidor da bomba de protões em conjunto com os antibióticos ajuda a aliviar os sintomas relacionados com a úlcera (isto é, dor abdominal, náuseas), ajuda a curar a inflamação da mucosa gástrica, e pode aumentar a eficácia dos antibióticos contra o H. pylori na superfície da mucosa gástrica. Actualmente, oito regimes de tratamento com H. pylori são aprovados pela Food and Drug Administration (FDA) (Quadro 1); no entanto, várias outras combinações têm sido utilizadas com sucesso. A resistência aos antibióticos e a não conformidade do paciente são as duas principais razões para o fracasso do tratamento. As taxas de erradicação dos oito regimes aprovados pela FDA variam entre 61% e 94%, dependendo do regime utilizado. Em geral, os regimes de tripla terapia têm mostrado melhores taxas de erradicação do que a dupla terapia. Uma duração mais longa do tratamento (14 dias versus 10 dias) resulta em melhores taxas de erradicação.
Muitos remédios naturais também foram sugeridos e demonstraram ter eficácia. Por exemplo, um estudo japonês de Abril de 2009 concluiu que os brócolos são um remédio natural eficaz da bactéria H. pylori. Pensa-se que os sulfanos encontrados nos rebentos dos brócolos têm propriedades antimicrobianas. Em 1998, um estudo israelita descobriu que extractos de canela inibiam as enzimas urease das reacções catalíticas nas células de H. pylori. Há várias outras substâncias que têm sido oferecidas para combater o H. pylori, incluindo ervas aromáticas como o alho e o gengibre, óleos como óleo de coco e de orégãos e vinagre de cidra de maçã.