Margaret wurde 1046 geboren und war ein Mitglied einer alten englischen Königsfamilie. Sie war eine direkte Nachfahrin von König Alfred und über dessen Sohn Edward die Enkelin von König Edmund Ironside von England.
Margaret war mit ihrer Familie auf den östlichen Kontinent verbannt worden, als König Canute und seine dänische Armee England überrannt hatten. Sie war schön und fromm, aber auch intelligent und erhielt ihre formale Ausbildung in Ungarn.
Margaret und ihre Familie kehrten gegen Ende der Regierungszeit ihres Großonkels, Eduard des Bekenners, nach England zurück, da ihr jüngerer Bruder, Edgar der Ätherling, einen sehr starken Anspruch auf den englischen Thron hatte. Der englische Adel hatte jedoch andere Vorstellungen und wählte Harold Godwin zu Edwards Nachfolger.
Alle diese politischen Manöver erwiesen sich als irrelevant, als Wilhelm, Herzog der Normandie, auch bekannt als „der Eroberer“, 1066 mit seiner Armee bei Hastings eintraf, aber das ist eine andere Geschichte.
Als einige der letzten verbliebenen sächsischen Royals in England war die Position von Margaret und ihrer Familie prekär und aus Angst um ihr Leben flohen sie nach Norden, in die entgegengesetzte Richtung zu den vorrückenden Normannen. Sie waren auf dem Weg von Northumbria zurück zum Kontinent, als ihr Schiff vom Kurs abkam und in Fife landete.
Der schottische König, Malcolm III, bekannt als Malcolm Canmore (oder Great Head), bot der königlichen Familie seinen Schutz an.
Malcolm war besonders beschützend gegenüber Margaret! Sie lehnte seine Heiratsanträge zunächst ab, da sie nach einer Erzählung ein frommes Leben als Jungfrau vorzog. Malcolm war jedoch ein hartnäckiger König, und das Paar heiratete schließlich 1069 in Dunfermline.
Ihre Verbindung war außergewöhnlich glücklich und fruchtbar für sie selbst und die schottische Nation. Margaret brachte einige der Feinheiten der aktuellen europäischen Sitten, Zeremonien und Kultur mit an den schottischen Hof, was dessen zivilisierten Ruf stark verbesserte.
Königin Margaret war bekannt für ihren guten Einfluss auf ihren Ehemann und auch für ihre fromme Frömmigkeit und religiöse Observanz. Sie war eine treibende Kraft bei der Reform der Kirche in Schottland.
Unter Königin Margarets Führung förderten Kirchenräte die Osterkommunion und, sehr zur Freude der Arbeiterschaft, die Abstinenz von dienstlicher Arbeit am Sonntag. Margaret gründete Kirchen, Klöster und Pilgerherbergen und errichtete mit Mönchen aus Canterbury das königliche Mausoleum in der Dunfermline Abbey. Sie hatte eine besondere Vorliebe für schottische Heilige und veranlasste die Queen’s Ferry über den Forth, damit die Pilger den Schrein von St. Andrew leichter erreichen konnten.
Die Messe wurde von den vielen Dialekten des Gälischen, die in ganz Schottland gesprochen wurden, auf das vereinheitlichende Latein umgestellt. Indem sie Latein für die Feier der Messe annahm, glaubte sie, dass alle Schotten zusammen mit den anderen Christen Westeuropas in Einheit beten könnten. Viele glauben, dass es nicht nur das Ziel von Königin Margaret war, die Schotten zu vereinen, sondern auch die beiden Nationen Schottland und England in einem Versuch, den blutigen Krieg zwischen den beiden Ländern zu beenden.
Indem sie die Agenda für die Kirche in Schottland festlegte, stellte Königin Margaret auch die Dominanz der römischen Kirche über die einheimische keltische Kirche im Norden des Landes sicher.
Margaret und Malcolm hatten acht Kinder, alle mit englischen Namen. Alexander und David folgten ihrem Vater auf den Thron, während ihre Tochter Edith (die bei ihrer Heirat ihren Namen in Matilda änderte) die alte angelsächsische und schottische königliche Blutlinie in die Adern der normannischen Invasoren Englands brachte, als sie König Heinrich I. heiratete und ihm Kinder gebar.
Margaret war sehr fromm und kümmerte sich besonders um die Armen und Waisen. Diese Frömmigkeit führte dazu, dass ihre Gesundheit durch das wiederholte Fasten und die Enthaltsamkeit erheblichen Schaden nahm. Als sie 1093 nach langer Krankheit auf dem Sterbebett lag, erfuhr sie, dass ihr Mann und ihr ältester Sohn bei der Schlacht von Alnwick in Northumbia in einen Hinterhalt geraten und heimtückisch getötet worden waren. Sie starb kurz darauf im Alter von nur siebenundvierzig Jahren.
Sie wurde neben Malcolm in der Dunfermline Abbey begraben und die berichteten Wunder, die sich in und um ihr Grab ereigneten, unterstützten ihre Heiligsprechung im Jahr 1250 durch Papst Innozenz IV.
Während der Reformation gelangte der Kopf von St. Margaret irgendwie in den Besitz von Maria, der Königin der Schotten, und wurde später von den Jesuiten in Douai sichergestellt, wo man glaubt, dass er während der Französischen Revolution umkam.
Das Fest der heiligen Margareta wurde früher von der römisch-katholischen Kirche am 10. Juni begangen, wird aber jetzt jedes Jahr an ihrem Todestag, dem 16. November, gefeiert.