Pennsylvania, Maine, Massachusetts, Virginia und New Hampshire behaupten alle, der Geburtsort des Whoopie Pie zu sein. Das Pennsylvania Dutch Convention & Visitors Bureau merkt an, dass das Rezept für den Whoopie Pie aus der Amish- und Pennsylvania German-Kultur stammt – Ursprünge, die wahrscheinlich keine offizielle Spur hinterlassen haben – und über Generationen weitergegeben wurde. Labadie’s Bakery in Lewiston, Maine, stellt das Gebäck seit 1925 her. Die heute nicht mehr existierende Berwick Cake Company in Roxbury, Massachusetts, verkaufte bereits in den 1920er Jahren „Whoopee Pies“, brachte den Whoopee Pie aber erst 1928 offiziell und mit großem Erfolg auf den Markt. Verschiedene Behauptungen legen nahe, dass der Whoopee Pie seinen Ursprung in Massachusetts hatte und sich sowohl nach Norden als auch nach Süden ausbreitete, oder dass deutsche Einwanderer in Pennsylvania den Vorläufer des Whoopee Pie in Gemeinden im gesamten Nordosten brachten. Einen Hinweis darauf, wie die möglicherweise amische Nachspeise in Neuengland so populär wurde, findet man in einem Kochbuch aus den 1930er Jahren mit dem Titel Yummy Book der Durkee Mower Company, dem Hersteller von Marshmallow Fluff. In diesem Neuengland-Kochbuch wurde ein Rezept für „Amish Whoopie Pie“ mit Marshmallow Fluff in der Füllung vorgestellt.
Im Jahr 2011 erwog die Legislative des Bundesstaates Maine, den Whoopie Pie zum offiziellen Staatskuchen zu ernennen. Der Vorschlag erhielt parteiübergreifende Unterstützung. L.D. 71, offiziell bekannt als „An Act to Designate the Whoopie Pie as the State Dessert“, lautete: „The whoopie pie, a baked good made of two chocolate cakes with a creamy frosting between them, is the official state dessert“. Die Legislative von Maine entschied sich schließlich dafür, den Whoopie Pie zur offiziellen Staatsleckerei zu erklären und wählte den Blueberry Pie (aus wilden Maine-Blaubeeren) zum offiziellen Staatsdessert.