La terapia tradicional para la infección por H. pylori consiste en 10 días a 2 semanas de uno o dos antibióticos eficaces, como la amoxicilina, la tetraciclina (no debe utilizarse en niños <12 años.), metronidazol o claritromicina, más citrato de bismuto de ranitidina, subsalicilato de bismuto o un inhibidor de la bomba de protones. La supresión de la acidez mediante el bloqueador H2 o el inhibidor de la bomba de protones junto con los antibióticos ayuda a aliviar los síntomas relacionados con la úlcera (es decir, el dolor abdominal, las náuseas), ayuda a curar la inflamación de la mucosa gástrica y puede mejorar la eficacia de los antibióticos contra el H. pylori en la superficie de la mucosa gástrica. En la actualidad, la Food and Drug Administration (FDA) ha aprobado ocho regímenes de tratamiento de H. pylori (Tabla 1); sin embargo, se han utilizado con éxito otras combinaciones. La resistencia a los antibióticos y el incumplimiento de los pacientes son las dos razones principales del fracaso del tratamiento. Las tasas de erradicación de los ocho regímenes aprobados por la FDA oscilan entre el 61% y el 94%, dependiendo del régimen utilizado. En general, los regímenes de triple terapia han mostrado mejores tasas de erradicación que la terapia dual. Una mayor duración del tratamiento (14 días frente a 10 días) da lugar a mejores tasas de erradicación.
También se han sugerido muchos remedios naturales que han demostrado su eficacia. Por ejemplo, un estudio japonés realizado en abril de 2009 descubrió que el brócoli es un remedio natural eficaz contra la bacteria H. pylori. Se cree que los sulforfanos presentes en los brotes de brócoli tienen propiedades antimicrobianas. En 1998, un estudio israelí descubrió que los extractos de canela inhibían las enzimas de la ureasa para catalizar las reacciones en las células de H. pylori. Hay varias otras sustancias que se han ofrecido para contrarrestar el H. pylori, incluyendo hierbas como el ajo y el jengibre, aceites como el de coco y el de orégano y vinagre de sidra de manzana.