Ognuno di questi tre domini contiene un rRNA unico. Questo costituisce la base del sistema a tre domini. Mentre la presenza di una membrana nucleare differenzia gli Eukarya dagli Archaea e dai Bacteria, entrambi privi di membrana nucleare, distinti marcatori biochimici e di RNA differenziano gli Archaea e i Bacteria tra loro.
ArchaeaEdit
Gli Archaea sono cellule procariote, tipicamente caratterizzate da lipidi di membrana che sono catene idrocarburiche ramificate attaccate al glicerolo da legami eterici. La presenza di questi legami eterei negli Archaea aggiunge la loro capacità di resistere a temperature estreme e condizioni altamente acide, ma molti archaea vivono in ambienti miti. Gli alofili, organismi che prosperano in ambienti altamente salati, e gli ipertermofili, organismi che prosperano in ambienti estremamente caldi, sono esempi di Archaea.
Gli Archaea hanno evoluto molte dimensioni cellulari, ma tutte sono relativamente piccole. Le loro dimensioni vanno da 0,1 μm a 15 μm di diametro e fino a 200 μm di lunghezza. Sono circa le dimensioni dei batteri, o simili alle dimensioni dei mitocondri che si trovano nelle cellule eucariotiche. I membri del genere Thermoplasma sono i più piccoli degli Archaea.
BacteriaEdit
Anche se i batteri sono cellule procariotiche come gli Archaea, le loro membrane sono fatte di bilayer fosfolipidici. I cianobatteri e i micoplasmi sono due esempi di batteri. Caratteristicamente non hanno legami eterei come gli Archaea, e sono raggruppati in una categoria diversa e quindi in un dominio diverso. C’è una grande diversità in questo dominio. Confusi da questa diversità e dal trasferimento genico orizzontale, è quasi impossibile determinare quante specie di batteri esistono sul pianeta, o organizzarli in una struttura ad albero, senza collegamenti incrociati tra i rami.
EukaryaEdit
I membri del dominio Eukarya, detti eucarioti, hanno organelli legati a membrana (compreso un nucleo contenente materiale genetico) e sono rappresentati da cinque regni: Plantae, Protista, Animalia, Chromista e Fungi.