Cada um destes três domínios contém rRNA único. Isto constitui a base do sistema de três domínios. Enquanto a presença de uma membrana nuclear diferencia a Eukarya da Archaea e das Bactérias, ambas sem membrana nuclear, marcadores bioquímicos e de RNA distintos diferenciam a Archaea e as Bactérias uma da outra.
ArchaeaEdit
Archaea são células procariotas, tipicamente caracterizadas por lípidos de membrana que são cadeias ramificadas de hidrocarbonetos ligados a glicerol por ligações etéreas. A presença destas ligações etéreas no Archaea aumenta a sua capacidade de suportar temperaturas extremas e condições altamente ácidas, mas muitos arquebactérias vivem em ambientes suaves. Halófilos, organismos que prosperam em ambientes altamente salgados, e hipertermófilos, organismos que prosperam em ambientes extremamente quentes, são exemplos de Archaea.
Archaea desenvolveu muitos tamanhos de células, mas todos são relativamente pequenos. O seu tamanho varia de 0,1 μm a 15 μm de diâmetro e até 200 μm de comprimento. Têm aproximadamente o tamanho de bactérias, ou similar em tamanho às mitocôndrias encontradas nas células eucarióticas. Os membros do género Thermoplasma são os mais pequenos do género Archaea.
BacteriaEdit
Even embora as bactérias sejam células procarióticas tal como a Archaea, as suas membranas são feitas de camadas de fosfolípidos. As cianobactérias e os micoplasmas são dois exemplos de bactérias. Caracteristicamente, não têm ligações éteres como a Archaea, e estão agrupadas numa categoria diferente – e por conseguinte num domínio diferente. Há uma grande diversidade neste domínio. Confundida por essa diversidade e transferência horizontal de genes, é quase impossível determinar quantas espécies de bactérias existem no planeta, ou organizá-las numa estrutura de árvores, sem ligações cruzadas entre ramos.
EukaryaEdit
Os membros do domínio Eukarya-chamados eukaryotes- têm organelas de membrana (incluindo um núcleo contendo material genético) e são representados por cinco reinos: Plantae, Protista, Animalia, Chromista, e Fungi.